Plněné knedlíky se obvykle podávají jako hlavní chod, přičemž existují obě varianty - na sladko a na slano.

Slanou variantu obvykle tvoří bramborový knedlík plněný uzeným masem nebo uzeným bůčkem. Bramborové knedlíky posypeme dozlatova osmaženou cibukou a přelijeme rozpuštěným máslem. Slané plněné knedlíky můžeme podávat spolu s kyselým zelím.

Sladkou variantou jsou ovocné knedlíky, což jsou knedlíky z kynutého těsta plněné nejrůznějšími druhy ovoce, např. meruňkami, jahodami, borůvkami či švestkami. Ovocné knedlíky servírujeme posypané moučkovým cukrem, nastrouhaným tvarohem a rozpuštěným máslem.

Opět je nutné zmínit, že existuje celá řada variant a obměn jak těst, tak náplní a neexistuje jeden správný nebo tradiční recept.