Một deoxynucleotide mà thiếu một nhóm chức hiđrôxyl 3´, và do đó không thể tạo thành các trái phiếu phospho-diester 3´-5´ cần thiết cho chuỗi kéo dài. Di-deoxynucleotides được sử dụng trong trình tự DNA và điều trị các bệnh do virus. Cũng đôi khi được gọi là didnt.