Метод для секвенування довго (> 1 Кб) клоновані шматки ДНК. Секвенування реакцією початкова розкриває послідовність перші кілька сотень нуклеотидів клонованих ДНК. На підставі цих даних, грунтовка містять про 20 нуклеотидів і доповнює послідовності в кінці досліджені ДНК синтезується а потім використовується для секвенування наступного кілька сотень нуклеотидів клонованих ДНК. Цю процедуру повторювати доки визначається послідовність повний нуклеотид клонованих ДНК.