ส่วนของโปรตีนที่มีฟังก์ชันไม่ต่อเนื่องหรือ conformation ระดับโปรตีน โดเมนสามารถมีขนาดใหญ่เป็นครึ่งหนึ่งของโปรตีนทั้งหมด หรือขนาดเล็กที่ตกค้างของกรดอะมิโนกี่