AFP är protein som gjorts av den fostret lever, i det fetala gastrointestinala (GI) systemet och gulesäcken. Under graviditet, AFP korsningar till moderns blod. Nivå av AFP i moderns blod kan mätas med skärm för störningar såsom neurala röret brister och Down syndrom. Mor AFP nivåer tenderar att vara hög med neurala tube defekter såsom Anencefali och Spina bifida och låga med Downs syndrom.