Aktivni klor lahko enotni klora atom, ki je koren ("Cl dot") in je zato zelo reaktivna. , Ki je lahko tudi molekule, ki vsebujejo klor, ki je jalove (ClO). Aktivnega klora najbolj opazno vlogo v atmosferski kemiji je v katalitsko uničenje ozona v stratosferi in kopičenje aktivnega klora na zemeljske polar stratosferi polar ponoči, ki vodi k nastajanju luknjo večjih ozona med spomladi.