Одна молекула ДНК (двуспиральная), локализованная (в отличие от ядерной ДНК) в митохондриях; управляет развитием и функционированием содержащей её митохондрии. Так как воспроизведение осуществляется путем клонирования, мтДНК как правило передается по женской линии, как часть цитоплазмы яйцеклетки.