Harta locatii de repere identificare ADN-ului (de exemplu, site-uri de tăiere enzime de restricţie, gene), indiferent de moştenire. Distanţa este măsurată în perechi de bază. Genomul uman, harta fizică mai mici-rezoluţie este modele aplicare canturi pe 24 cromozomi diferite; harta cea mai mare rezoluţie este secvenței nucleotidice complete de cromozomi.