O método inicial de transgênese em animais, que envolve a injeção de muitas cópias de um gene específico em um dos dois pro-núcleos de um óvulos fertilizados. Characterised por uma taxa de sucesso muito baixa. Como animal clonagem (q.v.) torna-se mais comum, microinjecção pró-nuclear será substituída por microinjecção de genes clonados em uma cultura de embriões clonados, produzido por transferência nuclear, que pode ser testada para a expressão do transgene antes da transferência para fêmeas de destinatário.