Metoda sekwencjonowania długo (> 1 kb) sklonowanych fragmentów DNA. Początkowy sekwencji reakcji ujawnia sekwencji pierwszej kilka nukleotydów kilkaset klonowania DNA. Na podstawie tych danych, podkład, zawierające około 20 nukleotydów i uzupełniające w stosunku do sekwencji pod koniec sukcesywnych DNA jest syntetyzowana i jest następnie używana do sekwencjonowania następne kilka nukleotydów kilkaset klonowania DNA. Tę procedurę należy powtórzyć, aż sekwencji nukleotydów kompletny klonowania DNA jest ustalona.