Aktiv klor kan være en enkelt klor atom som er en radikal ("Cl punkt") og det er derfor svært reaktivt. Det kan også være et molekyl som inneholder klor som er reaktive (ClO). Aktiv klors mest kjente rolle i atmosfæriske kjemi er i katalytisk ødeleggelsen av ozon i stratosfæren og akkumulering av aktiv klor på jordens polar stratosfæren under polarnatten som fører til store ozon hullet formasjonen i løpet av våren.