Micro-eencellige organismen waarvan de cellen een nucleus ontbreken. Bacteriën omvatten een belangrijke domein van het leven genoemd prokaryoten. Daarentegen de cellen in eukaryoten hebben een welomschreven nucleus; eukarya bevatten schimmels, planten en dieren. Een andere grote domein heet archaea, micro-organismen met genetische kenmerken van prokarya en eukarya onderscheiden. Meeste methaan-producerende bacteriën zijn eigenlijk archaea, maar voor de eenvoud vele biologen informeel verwijzen naar alle niet-eukaryoten als "bacteriën. "