II ierobežojumu enzīmi, kas sagriezti katrā pavedienā atsevišķā vietā tipa ierobežojums fragmentu atstāja vienu balasta nukleotīdu secību. Nepāra šajos reģionos ir pieejami hibridizācijas papildina citus fragmentus beidzas ar rekombinanto DNS izveides laikā. aka izvirzītās beigu pārkares; saliedēta gala.