Termins, ko lieto, lai aprakstītu jebkuru procesu vai fermentu, kas darbojas pie noteiktiem DNS vai RNS molekulas secības. II tipa ierobežojums fermenti ir konkrētās vietas endonucleases un rekombinācijas kodēti ar dažiem transpozonu sistēmām ir konkrētās vietas, piemēram, ir integrācija, fāgu vērā . E. coli hromosomu.