Metode pēc klonešanas lielu reģionu hromosomu. Sākot no zināmas vietas, gēnu bibliotēka tiek demonstrēti klonus, kas hybridize DNS zondes, kas ņemti no pirmā klons beidzas. Šiem kloniem pēc tam tiek izdalīts, un to izmanto, lai bibliotēka atkal ekrāna gali. Šiem kloniem pēc tam tiek izolēts un izmantot to gali, un tā tālāk.