Papildus ierobežojumu enzīmu DNS parauga saskaņā ar īpašiem nosacījumiem vai uz noteiktu laiku, tāda, ka tikai daļu no mērķa vietnes jebkuru individuālu molekulā ir šķelt. Daļēja hidrolizētie bieži tiek veikti dot pārklājas kolekcija DNS fragmentu izmantošanai gēnu bankas būvniecībā.