特定の DNA シーケンス (オペレーター) に結合するタンパク質遺伝子、オペロンの転写開始サイトから上流と RNA ポリメラーゼの mRNA 合成の開始を防ぐ。リプレッサーの例はバクテリオファージの C ₁ 蛋白質と lac オペロンの ラック 1 蛋白質。