Segmen DNA yang mampu, setelah reaksi hibridisasi DNA, untuk mendeteksi suatu urutan DNA tertentu dalam campuran urutan berlabel (tagged). Jika urutan tagged melengkapi salah satu dalam campuran, urutan dua akan membentuk heliks ganda. Ini akan diidentifikasi berkat label (baik oleh radioaktivitas atau fluoresensi).