Egy olyan osztályozási mintára, jelezve, melyik plazmidok egyetlen cellán belül is létezhetnek. Plazmidok különböző összeférhetetlenség csoportok léteznek belül ugyanazt a cellát kell tartoznia. Összeférhetetlenségi csoportba tartozó plazmidok instabil, ha ugyanarra a cellára. A plazmid klónozás vektor mindig eltér a befogadó baktérium endogén plazmidok összeférhetetlenség csoporthoz kell tartoznia.