Vezanje tvari ili njenih metabolita iz reakcija faze I, s endogenim molekulama (konjugacija), čime nastaju derivati lakše topivi u vodi koji se mogu izlučiti putem urina ili žuči. Napomena: Reakcije faze II uključuju glukuronidaciju, sulfaciju, acetilaciju, konjugaciju aminokiselina (npr. glicina) i glutationa.