Perkutano znači kroz kožu". Kod PCN, kirurg i urolog prave rez dug 1 cm pod lokalnom anestezijom na leđima pacijenta, kroz koji umeđu napravu zvanu nefroskop izravno u bubreg i, ako je potrebno, ureter. Manji kamenci mogu biti fizički uklonjeni. Veći kamenci moraju se razbiti ultrazvukom, elektrohidraulički ili sondama s laserskim vrškom prije nego se uklone. U bubrege se može umetnuti cjevčica radi drenaže.