Bolest u kojoj se imunološki sustav, prirodno dizajniran za zaštitu tijela od stranih napadača kao što su virusi i bakterije, umjesto toga okrene protiv i uzrokuje štetu zdravim tkivima tijela. Imunološki sustav je kompleksna organizacija unutar tijela koja je normalno dizajnirana za "traženje i uništavanje" napadača na tijelo, uključujući i infekciozne agense. Pacijenti oboljeli od autoimunih bolesti obično imaju neuobičajena protutijela koja kruže njihovom krvlju i napadaju tkiva vlastitog organizma.

Primjeri autoimunih bolesti uključuju sistemski lupus, eritematozu, Sjergenov sindrom, Hashimotovu bolest, reumatoidni artritis, juvenilni dijabetes (tip 1), poliomijelitis, sklerodermu, Addisonovu bolest, vitiligo, pernicioznu anemiju, glomerulonefritis i plućnu fibrozu.

Autoimune bolesti su češće kod žena nego kod muškaraca. Smatra se da estrogen kod žena može utjecati na imunološki sustav kako bi kod nekih žena stvorio uvjete za autoimune volesti. Nadalje, prisutnost jedne autoimune bolesti povećava mogućnosti razvoja druge autoimune bolesti u isto vrijeme.