Les bactéries photosynthétiques aquatiques, souvent appelées algues bleu - vert, mais n'ont aucune relation d'algues. Cyanobactéries tirent leur nom de la phycocyanine pigment bleuâtre, qu'ils utilisent pour capturer la lumière pour la photosynthèse. Ils contiennent également de la chlorophylle a, le même pigment photosynthétique trouvés dans les chloroplastes des plantes. Pas toutes les bactéries « bleues » sont en bleus ; certaines formes courantes sont rouges ou roses, résultant de la phycoérythrine de pigment.