Võimalik protsessi, mis lisab väike DNA molekuli (tavaliselt poolt homoloogilise rekombinatsioon) suurem üks. Kui molekulid on ümmarguse integratsiooni hõlmab ainult ühte crossing-over; kui lineaarne, siis kaks ristmed üle on vaja. Tuntud näide on integratsiooni phage λ (lambda) DNA on E. coli genoomi.