Μια φυσική διαδικασία με την οποία ένα υδατικό σύστημα χρησιμοποιεί μικροβίων, που μετατρέπουν η επικρατούσα ουσιών στα Πρωτόπλασμα ή στα κελιά, για τον ίδιο καθαρισμό από ρύπους.