En mærket (mærkede) segment af DNA, der er i stand efter en DNA hybridisering reaktion, at registrere et bestemt DNA sekvens i en blanding af sekvenser. Hvis de mærkede sekvens er et supplement til en i blandingen, de to sekvenser vil danne en dobbelt helix. Dette vil blive identificeret takket være dens etiket (enten af radioaktivitet eller fluorescens).