Když člověk, který je již napaden virem HIV se nakazí s druhým a odlišné kmenem viru HIV. Superinfection může způsobit HIV postupovat rychleji. Superinfection lze také zkomplikovala zacházení, je-li nově nabytou kmen viru HIV rezistentních (ARV) antiretrovirální léky v současné HIV dávek osoby.