Quan el sistema immunitari és incapaç de protegir el cos de la malaltia. Aquesta condició pot ser provocat per la malaltia (com la infecció per VIH o càncer) o per certes drogues (com els utilitzats en la quimioteràpia). Persones amb sistemes immunes es comprometen no hauria de rebre les vacunes en directe, "atenuats".