البكتيرية أو الفطريات أو الطحالب المجهرية عن طريق الخطأ أدخلت إلى الثقافة أو الثقافة المتوسطة. الملوث قد كسا الخلايا النباتية ونتيجة لذلك تحول دون نموها. يجب أن يمارس العمل تحت ظروف معقمة مع إجراء استبعاد صارمة من الملوثات المحتملة في زراعة الأنسجة النباتية.